Polipeptídeos de cadeia simples com aproximadamente 65 aminoácidos (7 kDa) de sanguessugas e que possuem uma extremidade aminoterminal hidrofóbica neutra, uma extremidade carboxiterminal hidrofílica ácida e uma região central compacta hidrofóbica neutra. As hirudinas recombinantes não são sulfatadas na tirosina-63, e então, são denominadas 'hirudinas-dessulfatadas'. Formam um complexo estável não covalente com a ALFA-trombina, abolindo, assim, sua capacidade de clivar FIBRINOGÊNIO.