ARN preparado usualmente por transcripción a partir de ADN clonado, el cual es complementario de un ARNm específico o ADN y que se usa generalmente para estudiar genes de virus, distribución de ARN específico en tejidos y células, integración de adn viral a los genomas, transcripción, etc. En tanto es preferible usar las SONDAS ADN a nivel macroscópico para detectar la presencia de ADN/ARN de especies o subespecies específicas, las sondas arn se prefieren para estudios genéticos. El marcaje convencional para las sondas arn incluyen los radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina. Las sondas arn pueden dividirse por categorías en sondas arn de sentido +, sondas arn de sentido -, o sondas arn antisentido.