Parte da molécula de rna mensageiro que sofre uma alteração conformacional depois de se ligar a um metabólito específico ou outra molécula pequena, regulando, assim, a transcrição do rna mensageiro, o processamento pós-transcricional, o transporte, a tradução ou estabilidade em resposta a níveis variáveis do metabólito ou outra molécula pequena.