Ett transmembranområde innehållande efrin med hög affinitet till EPHB1-, EPHB3- och EPHB4-receptorn. efrin-b2 uttrycks i ett flertal vävnader hos vuxna. Under embryobildningen kan iakttas höga nivåer av efrin-b2 i prosencefalon, rombencefalon, somiter under utveckling, lemanlag och gälbågar.