1/182. XP borttagningar associeras med autism i tre honor. Vi rapporterar åtta hondjur med små borttagningar av den korta armen av x-kromosom, varav tre visade funktioner av autism. Våra resultat tyder på att det kan finnas en kritisk region för autism hos hondjur med Xp borttagningar mellan pseudoautosomal gränsen och DXS7103. Vi betraktelser att denna effekt kan betalas antingen till förlusten av funktionen av en specifik gen inom regionen borttagna eller till funktionella nullisomy följd av x inaktivering av den normala X-kromosomen. ( info) |
2/182. Fibroblast growth factor homologa faktor 2 (FHF2): gene struktur, uttryck och mappning till regionen Borjeson-Forssman-Lehmann syndrom i Xq26 som avgränsas av en dubblering brytpunkt i en BFLS-liknande patient. Borjeson-Forssman-Lehmann syndrom (BFLS) är en syndromal X-linked förståndshandikapp, som mappas av koppling till regionen q26 i den mänskliga X-kromosomen. Vi har identifierat en manlig patient med BFLS-liknande funktioner och en överlappning, 46,Y,dup(X)(q26q28), ärvt från sin ut efter fenotypiska kriterier normala mor. fluorescens i situ hybridisering med jäst konstgjorda kromosom kloner från Xq26 lokaliserade dubbelarbete brytpunkt till ungefär 400-kb intervall i regionen Xq26.3 mellan DXS155 och DXS294/DXS730. Databassökningar och analys av tillgängliga arvsmassans dna-sekvens från regionen avslöjade närvaron av fibroblast growth factor homologa faktor gen, FHF2, inom intervallet brytpunkt dubbelarbete. FHF2 gen struktur fastställdes och två nya exons identifierades, inklusive en ny 5' slutet exon, 1B. FHF2 är en stor gen som sträcker sig över ca 200 kb i Xq26.3 och består av minst sju exons. det visar vävnad-specifika alternativ splicing och alternativa transkription börjar. Norra blot hybridisering visade högsta uttrycket i hjärnan och skelettmuskulatur. FHF2 gen lokalisering och mönster vävnad-specifika uttryck tyder på att en kandidat genen för familjär fall av BFLS syndrom och andra syndromal och icke-specifika former av X-linked utvecklingsstörning mappning till regionen. ( info) |
3/182. Campomelic syndrom och borttagning av SOX9. Den mänskliga genen för SOX9, beläget i kromosom regionen 17q24.1-25,1, kodar en transkriptionsfaktor som deltar i chondrogenesis och testikel utveckling. Mutationer i denna gen orsaka campomelic syndrom (CMPS) med autosomal kön återföring. Här beskriva vi en nyfödda flicka med CMPS och en varvad radering på den långa armen på kromosom 17 (46,X,del(17)(q23.3q24.3). Omfattningen av SOX9 borttagning på en kromosom 17 definierades med unik teckensekvens fluorescerande in situ-hybridisering sonder. Detta är den första rapporten av en patient med CMPS försedda med en fullständig borttagning av en SOX9 gen, och som sådan är den starkaste belägg för DOS-beroende åtgärd av SOX9 proteinet i normala chondrogenesis. ( info) |
4/182. Två patienter med (romanen BCR/ABL fusion Betyg e8/a2 och e13/a2) som följer flyttning brytpunkter inom BCR exons. Vi har identifierat romanen BCR-ABL mRNA sträcka med RT-PCR i två patienter med philadelphia (Ph) kromosom positiva leukemi. Sekvensering avslöjade i bildruta sträcka som består av en del av BCR exon e8 spliced till ABL exon a2 i en patient och en del av BCR exon e13 spliced till ABL exon a2 i den andra. Raster inom BCR exons e8 och e13 stred mot samförstånd skarv webbplatser, vilket tyder på att aberrant fusion mRNAs kan ha uppkommit till följd av flyttning brytpunkter på dessa platser. Detta bekräftades av arvsmassans dna-bubblan PCR för andra patienten. Dessa uppgifter visar att BCR-ABL flyttning brytpunkter ibland kan uppstå inom kodning exons. ( info) |
5/182. Neocentromere vid 13q32 i en av två stabila markörer som härrör från en 13q21 paus. En 10-månader gammal flicka med Psykomotorisk retardation, mikrocefali, bilaterala mikroftalmi, och postaxial polydaktyli fötterna var karyotyped med värdeområdesalternativ tekniker och (enkla eller dubbla färg) fluorescerande in situ-hybridisering (FISH) med fyra sonder: D13Z1/D21Z1, pancentromeric, pantelomeric och en blandning av 13q subtelomeric och 13/21 alphoid gånger. Hon befanns ha 47-kromosom Karyotyp där en normal 13 ersattes av två stabila markörer som härrör från en brytpunkt vid 13q21.1, nämligen en del(13)(q21.1) och en isofragment(13) (qter--> q21. 1::q21.1--> qter). Den senare hade en enda C-negativ men cd-positiva primära förträngning på 13q32, som dock inte var uppenbart i ca 12 procent av cellerna. FISK studier visade att de små 13q - hade 13-centromer och en 13q telomer (som visas för en viss 13q subtelomeric signal) till den brutna avsluta isofragment saknade alphoid signaler men hade 13q subtelomeric sekvenser i båda ändar. Föräldrarnas karyotypes var normala. Patientens ommöbleringen representerar den åttonde kromosom-13-härledda markören med nonalphoid neocentromere finns på 13q. Alla sådana neocentromeres har beskrivits i 29 markörer som härrör från kromosomer 2, 3, 8-11, 13-15, 20, och y och trovärdigt resultat från den Epigenetiska aktiveringen av en latent centromer, som kan även vara en telomer med neocentric verksamhet. 13Q telomer hittades i del(13q) tillfångatogs troligen från den homologa kromosomen. ( info) |
6/182. En locus för isolerade klyka smak, beläget på mänsklig kromosom 2q32. Vi lägger fram bevis för förekomsten av en roman kromosom 2q32 locus som patogenesen vid isolerade klyka gommen. Vi har studerat två icke-närstående patienter med påfallande likartade kliniska särdrag, i vilka det är tydligen balanserade, de novo cytogenetiska rearrangements omfattar samma område i kromosom 2q. Båda barn har klyka gommen, foto dysmorphism och milda lärande funktionshinder. Deras karyotypes rapporterades ursprungligen som 46, XX, t(2;7)(q33;p21) och 46, XX, t(2;11)(q33;p14). Våra molekylär cytogenetiska analyser lokalisera dock båda flyttning brytpunkter till en liten region mellan markörerna D2S311 och D2S116. Detta tyder på att dessa brytpunkter sant placering är 2q32 snarare än 2q33. För att få oberoende stöd för förekomsten av en klyka-gomspalt locus i 2q32, framförde vi en detaljerad statistisk analys för alla fall i den mänskliga cytogenetics databasen av nonmosaic, sammanhängande autosomala borttagningar som är associerade med orofacial clefting. Detta uppenbarade 2q32 som en av endast tre kromosomal regioner där haploinsufficiency är betydligt associerad med isolerade klyka gommen. Tillsammans ger våra data starka bevis för läge i 2q32 av en gen som är avgörande för utvecklingen av de sekundära gommen. Närheten av dessa två flyttning brytpunkter bör också möjliggöra snabba framsteg mot positionella kloning av denna klyka-gomspalt gen. ( info) |
7/182. Partiell monosomi av distala 10q: tre nya fall och en översyn. Vi rapportera om 3 patienter med partiell borttagningar av den långa armen av kromosom 10-46, XY, del (10)(q26.2), 46,XX,del(10) (q25.3q26.3) eller 46,XX,del(10)(q26.1) och 46, XX, del (10)(q26.1). De jämförs med andra kända fall med varvad eller terminal borttagningar kromosom band 10q25 eller q26. Unik manifestationer är identifierade, inklusive skolios och en allvarlig beteende störning med uppmärksamhet underskott och Hyperaktivitet i en 12-årig pojke, samt bristfällig alopecia i en 6-årig patient. ( info) |
8/182. Hoppning flyttningar med 11q i ett non-Hodgkin-lymfom. Denna vitbok presenteras resultaten av en cytogenetiska analys i en 11-årig pojke med non-Hodgkin lymfom. Undersökningen utfördes i bilder från kortsiktiga kultur lymfkörteln celler. Analyserna visade en onormal klon med förlust av Y, få en x-kromosom, t(3;22), trisomi 11 och tre cytogenetically-relaterade subkloner med hoppning flyttningar som inbegriper 11q13 som regionen gemensamma brytpunkt. Denna region är en ovanlig plats av kromosom brott i hoppning, flyttningar, och har inte rapporterats hittills. I motsats till de flesta publicerade rapporter associeras det hoppning flyttning i vår patient med lång överlevnad. ( info) |
9/182. Kromosom 16 inversion-associerade flyttning: två nya fall. Två patienter med kromosom 16 inversion-associerade flyttning studerades med konventionella Cytogenetiska och fluorescens i situ-hybridisering (FISH) teknik. Samma kromosom 16 var inblandad i inversion och flyttning i båda patienter. Kromosom flyttning brytpunkt var belägna inom heterokromatin av kromosom 16 men utanför domänen alfa satellit i t(10;16) av den första patienten, medan det var utanför heterokromatin i det andra fallet med t(1;16). Dessa två typer av rearrangements kan bero på olika mekanismer och illustrera svårigheterna i att erkänna kromosom 16 inversion utan fisk studier. ( info) |
10/182. Alu och translisin erkännande webbplats sekvenser flankerande flyttning webbplatser i en ny typ av chimeric bcr-abl avskrift föreslå en eventuell allmän mekanism för bcr-abl brytpunkter. BAKGRUND och mål: Vi kännetecknas ytterligare en ny typ av chimeric BCR-ABL mRNA avskrift påvisats hos en patient med philadelphia kromosom positiva (Ph ) kronisk myeloisk leukemi (CML). DESIGN och metoder: Vi använt omvänd transkription Polymeras-kedjereaktion (RT-PCR) och sequence analysis i regionen fusion i amplifierade cDNA fragment. Västra analys framfördes den sammanlagda proteinhalten. RESULTAT: Del av exon e8 av BCR-gen gick en intronic sekvens med ABL intron Ib spliced på exon a2 av ABL gen, ger upphov till en i-frame e8-int-a2 BCR-ABL avskrift. Endast en del av exon 8 av BCR-genen (e8) (intra-exonic bryta) bibehölls. Den därav följande BCR-int-ABL avskriften översattes till BCR-ABL proteinet 1804 aminosyra resthalter med en molekylmassa 197,5 kilodaltons (kDa) kallas p200 BCR-ABL. 3' Del av bcr exon 8 nykombinerade inom eller vid sidan av Alu element vid de ytterligare platserna. Sekvens motiv som liknar samförstånd bindande platser av de lymfoida-associerade TRAX och translisin proteinerna var närvarande på båda deltagande delarna på 22q11 och 9q34 rekombination platser, respektive. Inga skillnader i klinisk eller laboratorieresultat vid diagnos konstaterades mellan denna patient och CML patienter med bcr-abl fusion. TOLKNING och slutsatser: Föreslår närvaron av Alu sekvenser och translisin bindande motivet på båda sidor om avbrott i denna roman flyttning en möjlig allmän mekanism av molekylär rekombination i CML patienter. ( info) |